Zotero | 两台设备的pdf文件同步问题

菟斯基

最近研究生快要开学了，我的老电脑也非常识趣地坏了电池，让我有理由换了台新电脑。之前在老电脑上使用zotero+坚果云保存看的文献，换了电脑之后自然要进行文献同步。但是老电脑的zotero配置是很久之前弄的了，在同步文件到新电脑的时候遇到了找不到pdf文件等一些智障问题，在此记录一下，希望能帮到遇到相似问题的人。
下面的记录我会用（老/新）标记旧电脑和新电脑。
<hr/>0. Zotero的基础设置

这里就不详细说了，网上找zotero+坚果云+zotfile有茫茫多的教程。这里只给一些重要的说明：



图1  zotero同步界面（老，新一样）

如果使用坚果云作为同步的存储中介，这个界面就是配置同步的账户信息，以及连接到自己的坚果云上的。



图2  zotero文件管理（老）

文件管理界面是比较让人摸不着头脑的，也是导致我新电脑找不到pdf文件的一个重要原因，后续会对个界面进行说明。
1. 初遇问题

在拿到新电脑安装zotero后，首先去同步界面登录账号和设置坚果云同步，和老电脑一样（图1）。



图3  主界面（老）

右上角的是同步按钮。过去我对zotero的理解就是可以实现傻瓜式的同步，在老电脑上点击同步就会把文献和pdf推送到坚果云和zotero自己的服务器，在新电脑上再点击同步就能把所有文件下载下来实现迁移。正当我沉浸于zotero的便利时新电脑立马给了我一拳：



图4  （新）

也就是说zotero只把图3里的那些标签、链接什么的同步了下来，最重要的pdf原件没了。于是我就踏上了漫漫寻找pdf的道路。首先，我去坚果云那里找了一下pdf，发现：


我的pdf呢？不死心的我下载了一个zip文件并解压，也没找到pdf。于是只能去网上找各种教程。
2. zotero文献管理逻辑

网上搜zotero两台设备实现文献同步，基本上讲的还是配置坚果云啥的，大部分的出发点是一个新用户刚开始用zotero怎么设置路径、怎么配置坚果云，没有针对我这种已经记不得老电脑zotero配置的用户在新电脑上找不到pdf的情况。
作为计算机系的学生，对这种文献管理工具还是有一些理解上的直觉的，即zotero的每一个条目应该都是一个pdf的链接，至于pdf本体在哪完全取决于个人的设置。既然新电脑已经对条目进行了同步，所以问题就是要怎么在新电脑的条目上再次匹配好对应的pdf文件。所以解决这个问题就要理解zotero在保存文件的同时到底对文件做了啥，把文件放到哪去了。
经过整合网上各种杂糅信息，我发现问题主要出现在zotero和zotfile之间的关系上。下面对这两个东西对文件的管理进行一个简单的说明：



图5  zotero文件保存（老）

首先是老电脑上的zotero文件管理部分。

• 链接附件的根目录：链接附件指的就是文献pdf。链接附件的根目录是一个相对路径的前缀，指的就是zotero会在这个根目录下找pdf文件，并和条目对应起来。假设zotero里有一个条目是“paper1”，双击“paper1”zotero就会去“D：\zotero\files\paper1”（以我的路径为例）把paper1这个pdf打开。因此，根目录必须和pdf文件所在的文件夹相同，否则zotero只有一个条目，而不知道去哪找这个条目下的pdf。
  
• 数据存储位置：这里的数据并非文献pdf，而是指zotero条目的一些数据，包括笔记、标签等等。这里大家存在哪都可以，我的笔记记在了notion上，占不了多大地方所以用了默认路径，也可以自定义一个文件夹，反正这一部分可以傻瓜式同步。
  

这里就是zotero对文件管理给出的所有配置方式。但是，大部分人的诉求是：由于文献pdf一般较大，我想把文献pdf保存到自定义的文件夹里，这要怎么弄?
zotero本体是没有提供这个选项的，我们一般通过zotfile这个插件实现。zotfile的核心功能就是对pdf文件的自动重命名，以及pdf文件的搬运。下面再说一说关键的pdf文件搬运，工具-Zotfile Preferences打开界面：



图6 zotfile文件管理（老）

• Source Folder for Attaching New Filse：这一部分我没有设置，如果设置了这个部分，那么zotfile就会对设置路径下的文件进行监控，如果文件夹里出现了新的Pdf，zotfile就会把这个pdf自动重命名并且搬运到指定的位置。由于我都是从chrome浏览器的插件一键保存文件，所以这个功能暂时用不到
  
• Locations of Filse：这个部分是文献pdf的保存位置。也就是说如果我们用chrome上的插件一键保存文献到zotero，zotfile就会把pdf文件搬运到Custom Location那里。注意，这里的路径和图5中的链接附件的根目录要保持一致，否则zotero就会找不到pdf在哪。
  

3. 问题解决

明白了zotero+zotfile对文件的保存逻辑，问题就迎刃而解了。在新电脑里按照图5的1进行相同的设置，再使用U盘把pdf文件拷贝到新电脑的D：\zotero\files下就OK了。
One more thing

问题到这里也就解决了，又可以开始愉快（）的科研生活了。但是冥冥之中我总感觉这种解决方法不够优雅，按理说一键傻瓜式的文献同步才是应该存在的。或许是我在老电脑上配置zotero时就有一些问题，导致了后续的问题。如果大家有好的建议欢迎评论:)。

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之所以没有把pdf同步是因为你在旧电脑上用zotfile把pdf转移到你设定的地址了，导致zotero/sotrage里面没有pdf文件，而zotero的webDAV同步只能同步zotero/sotrage里面的东西。

高庆康

[好奇]学到了